Отпечатайте на УФ принтере шкалу или лучше сетку с шагом в 5 или 10 мм. То же самое в режиме слабого луча (векторная гравировка) нарубите на фанере с помощью лазера. Посмотрите обычной линейкой кто же виноват в несоблюдении размеров - принтер или лазер. Ну а далее делайте выводы и ищите виновную константу или галочку в настройках.
Кстати, УФ принтер у вас давно? Какие впечатления, проблемы?